| № | Код IATA | Аэропорт | Город |
| 1 | EPU | Аэропорт Пярну (Parnu Airport) | Пярну |
| 2 | KDL | Аэропорт Кярдла (Kardla Airport) | Кярдла |
| 3 | TAY | Аэропорт Тарту (Tartu Airport) | Тарту |
| 4 | TLL | Аэропорт Таллинн (Ulemiste Airport) | Таллинн |
| 5 | URE | Аэропорт Курессааре (Kuressaare Airport) | Курессааре |